Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CgnP59242 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CgnP59242 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CgnP59242 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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