Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rad23aP54726 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms