Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TspoP50637 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TspoP50637 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms