Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtshP49935 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtshP49935 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CtshP49935 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtshP49935 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtshP49935 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CtshP49935 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CtshP49935 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtshP49935 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtshP49935 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtshP49935 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtshP49935 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtshP49935 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtshP49935 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtshP49935 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms