Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax9P47242 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax9P47242 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax9P47242 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms