Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Zic1P46684 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Zic1P46684 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms