Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
NodalP43021 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NodalP43021 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NodalP43021 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NodalP43021 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms