Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cd28P31041 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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