Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apex1P28352 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms