Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb9P20615 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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