Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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