Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P20040 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P20040 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
P20040 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms