Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxd4P10628 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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