Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P10404 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P10404 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P10404 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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