Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lnx1O70263 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Lnx1O70263 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms