Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC024978J3QPC3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms