Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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