Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Taf4bG5E8Z2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Taf4bG5E8Z2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms