Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp72F8VQC1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp72F8VQC1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms