Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms