Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M5A7VMS3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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