Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm2A2A7B5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms