Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3550W4VSN7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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