Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ush1cQ9ES64 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms