Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Usp29Q9ES63 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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