Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf6Q9DBU5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf6Q9DBU5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf6Q9DBU5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf6Q9DBU5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf6Q9DBU5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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