Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Lin37Q9D8N6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lin37Q9D8N6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms