Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Jam3Q9D8B7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Jam3Q9D8B7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms