Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem54Q9D7S1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem54Q9D7S1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem54Q9D7S1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Tmem54Q9D7S1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tmem54Q9D7S1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tmem54Q9D7S1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tmem54Q9D7S1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tmem54Q9D7S1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tmem54Q9D7S1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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