Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Capns2Q9D7J7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Capns2Q9D7J7 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms