Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NenfQ9CQ45 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms