Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atp1b4Q99ME6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms