Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TrabdQ99JY4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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