Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Apobec3Q99J72 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Apobec3Q99J72 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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