Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Thumpd1Q99J36 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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