Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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