Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hecw1Q8K4P8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hecw1Q8K4P8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms