Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin28aQ8K3Y3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms