Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lrrtm1Q8K377 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Lrrtm1Q8K377 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Lrrtm1Q8K377 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Lrrtm1Q8K377 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrrtm1Q8K377 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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