Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pkn3Q8K045 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms