Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LgsnQ8CIX8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms