Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Upp2Q8CGR7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms