Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms