Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Nhlrc3Q8CCH2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Nhlrc3Q8CCH2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nhlrc3Q8CCH2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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