Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnot2Q8C5L3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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