Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ttc28Q80XJ3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Ttc28Q80XJ3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ttc28Q80XJ3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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