Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NischQ80TM9 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
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