Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4Q6P1D7 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4Q6P1D7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4Q6P1D7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slx4Q6P1D7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms