Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pdzrn3Q69ZS0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdzrn3Q69ZS0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pdzrn3Q69ZS0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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