Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgd6Q69ZL1 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms